Общий вид(html-код) определяется шаблоном меню, menu.tpl. Чтобы открыть шаблон главного меню нужно зайти в "менеджер сайта" - "Шаблоны модулей". И найти в списке шаблонов "menu.tpl"

Цвета, параметры html-тэгов и пр. задаются css-стилями. В дизайне по-умолчанию большая часть отображения настраивается через стили.

Чтобы изменить стили главного меню (цвет, ширину, высоту и т.д.) нужно зайти в редактор "CSS системные". Для этого нужно зайти в "Менеджер сайта" - "Макеты страниц" и далее открыть на редактирование любой макет. В открывшемся макете будет вкладка "CSS системные".

Для того, чтобы, например, изменить цвет шрифта в главном меню, нужно определить какой стиль был применен для меню\нужного элемента, можно использовать инструкцию.

После того как вы узнали стиль в браузере, вы должны найти его описание в "CSS системные", и изменить как вам нужно.