Они возникают потому, что различные элементы сайта(к примеру, список товаров) генерируются путём многократного обращения к определённым сетам.

В этих сетах могут присутствовать переносы строк/пробелы/пустые строки, которые нужны для удобочитаемости кода.

После формирования структуры сайта браузером, обычно все эти пробелы попадают за пределы основных формирующих отображение элементов и оказываются между ними.

Так, в сете, который формирует ячейки таблицы, могут быть пробелы, но в исходном коде их не будет - они будут вынесены за пределы таблицы.